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shotgun和TMT shotgun和TMT-详情"Shotgun鸟枪法蛋白质组学是一种自下而上的蛋白质组学分析策略,这种分析策略将完整蛋白质酶解消化为小分子肽段,通过液相色谱进行分离后进行串联质谱分析,根据质谱数据信息如肽段母离子的质荷比(m/z)等结合生物信息学软件进行数据分析,以实现蛋白/多肽序列以及含量分析等。TMT串联质量标签是一种典型的Shotgun基于鸟枪法的蛋白质标记定量技术。同位素标记包括用合成的含有轻或重同位素的试剂化学修饰靶肽,
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2023-09-11 |
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分泌蛋白的组学检测 分泌蛋白的组学检测-详情"蛋白质是生物体细胞功能的直接执行者,也是保证生命过程正常进行的重要物质。蛋白质在核糖体上合成,经内质网和高尔基体进行加工,成为成熟的、有生物学功能的活性蛋白。蛋白质都是在细胞内合成,但是细胞外也有各种蛋白质,执行不同的生物学功能。所以,蛋白质在细胞内合成后,会被转运到不同的部位发挥其特定的作用。分泌蛋白就是在细胞内合成后,分泌到胞外起作用的蛋白质,如各种消化酶、激素、淋巴因
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2023-09-11 |
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SILAC技术和免疫共沉淀法结合质谱联用技术 SILAC技术和免疫共沉淀法结合质谱联用技术-详情"免疫共沉淀(Co-IP)是基于免疫学原理研究蛋白质相互作用的经典方法,通过使用靶蛋白特异性抗体来间接捕获与特定靶蛋白结合的蛋白,从而识别生理相关的蛋白-蛋白相互作用,并可通过质谱技术来鉴定新的相互作用蛋白质。SILAC(Stable isotope labeling using amino acids in cell culture)细胞培养条件下稳定同位素标记技术是一种基于同位素标记的蛋白定量技术。SILAC方法使用体内新
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2023-09-11 |
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高通量测序 高通量测序-详情"高通量测序技术,又称为二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS)是在一代测序技术上发展而来的新一代测序技术。高通量测序技术克服了一代测序技术通量低、成本高的缺点,使同时分析几十万到几百万条序列成为现实,在大幅度提高通量的同时,保证了测序结果的准确性,降低了测序成本。高通量测序技术的问世使得我们能快速、细致、全面、深入的分析一个物种的基因组和转录组序列,揭开这些遗传物质的神秘面
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2023-09-11 |
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SILAC最多可以标记多少样品 SILAC最多可以标记多少样品-详情"SILAC(Stable isotope labeling using amino acids in cell culture)细胞培养条件下稳定同位素标记技术是一种基于质谱的标记定量蛋白质组学方法,使用非放射性同位素标记来检测样品中蛋白质丰度的差异。SILAC通过正常的代谢过程标记细胞蛋白质组,利用含同位素标记的氨基酸培养基培养细胞,通过细胞正常的新陈代谢使所有新合成的蛋白质带上非放射性、稳定的含同位素的氨基酸,zuì后利用液相色谱
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2023-09-11 |
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iTRAQ iTRAQ-详情"iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)即同位素标记相对和绝对定量技术,是由AB SCIEX公司研发的一种基于标签的蛋白质定量技术。iTRAQ技术通过同位素标记来实现蛋白质定量研究,其基本原理为:将水解得到的蛋白质多肽N末端或赖氨酸侧链基团用同位素试剂标签标记,再将该混合物进行高精度串联质谱分析,根据信号峰强度等质谱信息实现对样品蛋白的定量和定性分析。iTRAQ含有8种不同的试剂标签,
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2023-09-11 |
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SRM、MRM与PRM的区别 SRM、MRM与PRM的区别-详情"MRM(Multiple Reaction Monitoring)多重反应监测也称SRM(selected reaction monitoring)选定反应监测,与PRM(Parallel Reaction Monitoring)平行反应监测技术是靶向定量蛋白质组学研究中两种不同的质谱数据采集模式,PRM是在MRM/SRM的基础上发展而来的,两者主要存在以下几点不同之处:(1)MRM/SRM一次监测每个前体离子/产物离子的转变,而PRM以高分辨率和高质量精度分
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2023-09-11 |
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swath-ms swath-ms-详情"SWATH-MS是一个新兴的用于非标记定量的蛋白质组学平台,该平台基于数据非依赖型采集(DIA)原理,用于同时进行蛋白质鉴定和定量。不同于传统的基于数据依赖型模式的质谱技术如Shotgun和SRM等,SWATH-MS从某种意义上说完整地记录了蛋白样品中任何可检测的前体离子的所有碎片信息,集Shotgun(高通量)和SRM(高准确性和重复性)的优点于一身,正在成为一种将深度蛋白质组覆盖能力与定量一致性和准确性相结合的技术。S
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2023-09-11 |